Los Grupos de Trabajo pueden ser ad-hoc o con un propósito específico y tener una duración limitada o ser permanentes.
El Comité Ejecutivo establecerá los siguientes Grupos de Trabajo:
- Grupo de Trabajo sobre la Pesca Pelágica;
- Grupo de trabajo sobre las pesquerías bentónicas y demersales;
- Grupo de Trabajo sobre la pesca ilegal, no declarada y no reglamentada (INDNR) y otras cuestiones conexas;
- Grupo de Trabajo sobre Acuicultura.
Cada uno de los Grupos de Trabajo debe discutir sus temas de manera transversal, considerando las cuencas:
- Zona del Atlántico Oeste;
- Zona del Atlántico Oriental;
- Zona del Océano Índico.